SureSelectXT HS target enrichment

Производитель: Agilent Technologies Inc., США

Область применения: Новый вариант набора для целевого обогащения – SureSelect XT HS.

Особенностью данного набора является использование молекулярных баркодов, которые, вместе с классической методикой маркировки дубликатов, позволяют значительно улучшить возможности детектирования низкокопийных соматичеких вариантов, что найдет свое применение в исследованиях, связанных с раковыми заболеваниями.

При помощи данного набора можно приготовить библиотеки как из высококачественной ДНК из различных тканей, так и из низкокачественной ДНК, выделенной из образов, фиксированных в формалине (FFPE). Классический протокол был значительно оптимизирован, и теперь гибридизация с целевыми зондами длится всего 90 минут, а для приготовления библиотеки требуется 10 нг ДНК.

Таким образом, набор для целевого обогащения SureSelect XT HS совмещает в себе преимущества классического метода маркировки дубликатов с методом детектирования дубликатов при помощи молекулярных баркодов, а оптимизированный для FFPE протокол делает набор SureSelect XT HS одним из самых продвинутых инструментов изучения соматических вариантов.

Основные преимущества:

• оптимизированный для FFPE протокол;
• исключение амплификации и секвенирования артефактов, которые ограничивают чувствительность NGS;
• использование молекулярных баркодов, что позволяет значительно улучшить возможности детектирования низкокопийных соматичеких вариантов;
• повышенная чувствительность обнаружения низкочастотных аллелей, до 1% или менее;
• сокращенное количество этапов подготовки библиотеки, предотвращающее потерю ДНК;
• процесс подготовки образцов стал быстрее и эффективнее с заранее подготовленными растворами реагентов master-mixed - гибридизация с целевыми зондами длится всего 90 минут;
• преобразование образцов в готовые к секвенированию библиотеки за 8 часов.